由于JavaScript可以创造出很多吸引人的视觉效果，有些网站喜欢使用JavaScript脚本生成导航系统。这也是比较严重的蜘蛛陷阱之一。虽然搜索引擎都在尝试解析JS脚本，不过我们不能寄希望于搜索引擎自己去克服困难，而要让搜索引擎跟踪爬行链接的工作尽量简单容易。
虽然有的搜索引擎在技术上可能获得JavaScript脚本中包含的链接，甚至可以执行脚本并跟踪链接，但对一些权重比较低的网站，搜索引擎觉得没有必要，不会费那个劲。所以网站上的链接必须使用最简单标准的HTML链接，尤其是导航系统。用CSS做导航系统一样可以实现很多视觉效果。
JavaScript链接在SEO中也有特殊用途，那就是站长不希望被收录的页面（比如没有排名意义的页面，重复内容页面等），不希望彻底权重的链接，可以使用JavaScript脚本阻挡搜索引擎爬行。
动态URL指的是数据库驱动的网站所生成的、带有问号、等号及参数的网址。一般来说动态URL不利于搜索引擎蜘蛛爬行，应该尽量避免。下面对动态URL及其静态化还有更详细的讨论。
有些网站为了实现某种功能，如记住用户登录信息、跟踪用户访问路径等，强制用户使用Cookies，用户浏览器如果没有启用Cookies，页面显示不正常。搜索引擎蜘蛛就相当于一个禁用了Cookies的浏览器，强制使用Cookies只能造成搜索引擎蜘蛛无法正常访问。